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植物非特异性磷脂酶C的研究进展

时间:2022-04-08 08:24:55  浏览次数:

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1 NPC的结构特点

早期研究认为,植物NPC基因与其他已知的植物磷脂酶基因家族成员没有任何关系,随着研究的不断深入,多序列比对分析结果发现,拟南芥NPC与结核分支杆菌的PLC同源性相近,并且具有3个相似的结构域[11]。高等植物的基因组通常包含几个基因编码家族,NPCs蛋白一般是由510~540个氨基酸残基组成。NPC蛋白含有1个主要的磷酸酯酶域,具有典型的酯酶活性(图1)。NPC蛋白不像其他植物脂质信号转导蛋白一样含有C2、XY、EF、PH、PX、ENTH、FYVE等结构域。多数植物的NPCs蛋白在N端都含有1个信号肽,信号肽后面接着是1个短的可变区域和1个包含ENRSFDxxxG序列的高度保守结构域,这个保守区域在磷脂酸结构域的开头部位。但是这个D端的信号肽在拟南芥NPC3、NPC4和NPC5蛋白中并未发现。TxPNR和DExxGxxDHV 2个不变的结构域在NPC蛋白的中间部位,在磷脂酸结构域的尾部有1个GxRVPxxxxxP结构域。在蛋白质C端的50~100个氨基酸序列是NPC序列最分散的部分,不同的NPC亚族具有不同的长度和保守序列。这部分序列通过与其他蛋白相互作用和确定蛋白质的位置,使得不同的NPC亚型具有不同的功能[11](图1)。

分析拟南芥AtNPC2蛋白的3D模型发现,它和土拉杆菌的酸性磷酸酶(AcpA)结构类似。植物PC-PLC的蛋白骨架是由β折叠和若干α螺旋组成的内涵蛋白构成(图2)。研究发现,构成土拉细菌AcpA活性部位的大多数氨基酸残基都是保守的,包括与未识别的金属阳离子结合的位点[13]。

AtNPC2蛋白预测模型发现,可变的C端包含1个帽子结构,这个结构保护了蛋白的活性中心,使得蛋白不能直接参与催化反应。这一发现与NPC蛋白序列分析结果一致。同时还发现,植物NPCs的活性位点形成了1个带强烈负电荷的口袋结构,该结构可能与磷脂基质的结合有关[13]。

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