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实时荧光PCR技术检测过敏原小麦的研究

时间:2022-04-08 08:20:12  浏览次数:

zoޛ)jitu׍uӝt}7Czל)IاZ)Ţ[ئxii材料与方法

1.1材料

实验于2008年8月在辽宁出入境检验检疫局技术中心实验室进行。实验所用小麦、大麦、燕麦、荞麦、黑麦、白芝麻、糙米、绿豆、玉米、黑大豆、雪豆、泰国香米、花豆、黑小豆、黄豆、豌豆、饭豆、黑大米、胡萝卜、大白菜、韭菜、油菜、花生米、高粱、薏米和小米这26份样品由大连农业科学院、沈阳农业大学等多家单位提供,或购于大连家乐福超市。TaqMan GEx PCR Master酶预混液购于美国ABI公司。用于DNA提取的主要试剂CTAB缓冲液配制方法为55 mmol/L CTAB,1 400 mmol/L NaCl,

20 mmol/L EDTA,100 mmol/L Tris-HCl,用10%盐酸调pH值至8.0,121℃,高压灭菌20 min,备用。实验采用的仪器有ABI 7300实时荧光PCR仪,核酸蛋白分析仪,台式高速冷冻离心机。

1.2方法

1.2.1基因组DNA的抽提采用宝生物工程(大连)有限公司生产的DNA提取试剂盒(货号:DV811A)并按其操作说明进行抽提样品的DNA。

1.2.2DNA浓度和纯度的测定 取5 μL DNA溶液加ddH2O梯度稀释至1 mL,使用核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计测260 nm和280 nm处的吸光值。DNA的浓度按照公式C=A×N×50÷1000计算获得,式中C为DNA浓度(μg/μL),A为260 nm处的吸光值,N为核酸稀释倍数。OD260=1.0表示双链DNA浓度为50 μg/mL。当OD260/OD280比值为1.7~1.9时,适宜于PCR扩增。

1.2.3引物和探针设计 根据NCBI上已公布的小麦管家基因GAG56D和Wx012基因的核酸序列,在引物的设计上对小麦管家基因检测引物和探针的退火温度的一致性、GC含量的相似性等因素进行了充分的考虑,采用DNAMAN 8.0软件设计了小麦管家基因GAG56D和Wx012基因的引物和探针。检测GAG56D基因的引物和探针序列中正向引物为:5′-CAA CAA TTT TCT CAG CCC CAA CA-3′;反向引物为:5′-TTC TTG CAT GGG TTC ACC TGT T-3′;探针为:5′-FAM-TTC CCG CAG CCC CAA CAA CCG C-Eclipse-3′。检测Wx012基因的引物和探针序列中正向引物为:5′-GTC GCG GGA ACA GAG GTG T-3′;反向引物为:5′-GGT GTT CCT CCA TTG CGA AA-3′;探针为:5′-FAM-CAA GGC GGC CGA AAT AAG TTG CC-Eclipse-3′。

1.2.4实时PCR反应体系和反应程序 实时PCR反应体系为:10×PCR buffer(含Mg2+)5 μL、正反向引物(10 μmol/L)各1 μL、探针(10 μmol/L)1 μL、dNTPs(10 μmol/L)2 μL、Taq DNA聚合酶(2.5 U/μL)0.2 μL、模板DNA(0.1~2.0 μg/μL)2 μL,加ddH2O补足至25 μL。实时PCR反应程序为:95℃、10 min,1个循环;95℃、15 s,60℃、1 min,40个循环,在每次循环的退火时收集荧光。检测结束后,根据扩增曲线和Ct值判定结果。

1.2.5结果判断同时进行的阴性、阳性、空白对照实验结果正常,检测样品有明显的荧光增幅曲线,且Ct值≤35,则判断样品中检出过敏原小麦成分。若检测样品荧光增幅曲线的Ct值为35~40,则应重新进行实时荧光PCR反应。再次扩增后的结果Ct值仍为35~40,可判断样品中检出过敏原小麦成分,否则可判断样品中未检出过敏原小麦成分。

1.2.6特异性实验选取与样品同科同属的物种,用于待测样品的特异性实验。

1.2.7灵敏度实验将小麦样品研磨粉碎处理后,按照不同的重量比分别添加到不含小麦过敏原基因的植物为原料的米粉基质中,制备成20.0、10.0、 5.0、2.0、1.0、0.5、0.2、0.1、0.0 mg/kg共9个梯度含量的添加样品。应用本方法分别进行检测,以确定本方法的检测灵敏度。

2结果与分析

2.1特异性分析结果

采用小麦管家基因GAG56D和Wx012基因引物和探针进行检测,26种样品经TaqMan 探针实时PCR扩增,只有小麦产生荧光信号,其余样品均未产生荧光信号(图1)。可见,本研究所采用的小麦管家基因GAG56D和Wx012基因检测引物和探针具有很好的特异性。

2.2灵敏度实验结果

检测结果表明(图2),含量分别为20.0、10.0、5.0、2.0、1.0 mg/kg的小麦过敏原添加样品均能很好地检出荧光信号,而低于0.5 mg/kg含量的添加样品则检测不出荧光信号。表明该方法对小麦过敏原基因的检测灵敏度较高,可达到1.0 mg/kg。

2.3实际应用检测

运用本方法共检测了280份实际样品。其中检测小麦原料样品73份,阳性符合率为100%。检测小麦加工制品95份,阳性符合率也为100%。检测婴儿食品和小食品112份,其中检出含有小麦过敏原基因的样品为21份,其余91份样品未检出小麦过敏原基因,这些结果与食品标签的标识相符合。由大量的实际应用结果可见,应用本方法检测小麦过敏原基因成分,具有较好的应用效果。

3讨论

目前针对食品过敏原的检测方法,主要有体内检测的皮肤实验和双盲安慰剂对照激发实验、体外检测的血清IgE实验和组胺释放实验,PCR检测以及实时荧光PCR检测方法等[4]。传统的体内检测实验直接检测是否存在过敏蛋白质,由于过敏蛋白质通常痕量存在而被食品基质掩盖,造成实验结果假阴性。DNA比蛋白质更耐受热处理和压力作用,尤其是对于一些过敏原很难获得相应的血清抗体。PCR方法中,在热变性条件下目标DNA可以有效提取而不像蛋白质提取时受食物基质的影响较大;它的另一个优点是它的稳定性,它不像蛋白质组成那样受地理条件和季节变化的影响。

实时荧光PCR技术与常规PCR相比,它具有特异准确、可有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点。可以通过在PCR扩增过程中检测产物的荧光信号积累实时监测整个PCR进程。因此可以通过实时荧光PCR方法更快更准确地检测出食品过敏原成分基因,从而判断食品中是否存在过敏原[5]。

本研究采用实时荧光PCR技术,建立了食品中过敏原小麦成分快速检测方法,方法的灵敏度高,检测低限可达到1.0 mg/kg;方法特异性强,与对照组25种样品无交叉反应。在实际应用检测中,共检测280份样品,阳性符合率为100%,具有较好的应用效果。该方法操作步骤简单,检测时限短,结果判断准确,适用于小麦过敏原的快速诊断和大量样品的检测。

参考文献:

[1] 黄峙,郭宝江. 食品过敏原检测与评价技术研究进展[J]. 食品科学,2003,24(8):240-244.

[2] 毛炜翔,高金燕,陈红兵.小麦过敏研究进展[J].食品科学,2007, 28(8):87-90.

[3] HEID C A,SREVRNS J. Real time quantitative PCR[J]. Genome Research,1996,6(10):986-994.

[4] 顾可飞,李春红. 食物过敏原及检测技术的研究进展[J]. 食品科技,2006,31(8):42-44.

[5] HIRD H,LLOYD J,GOODIER R, et al. Detection of peanut using real-time polymerase chain reaction[J]. Eur Food Res Technol,2003,217(3):265-268.

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